А такой вопрос, на кого лучше регистрировать ТМ и авторские права на код\сайт - юридическое лицо или физическое лицо?
ТМ - только на юр.лицо или предпринимателя.
может ли фирма работать с физ. лиц?
Да.
Момент подачи заявки на регистрацию ТМ в какой-то степени защищает эту ТМ от лица, которое возможно тоже подало заявку (плагиатчик например).
Да, но только того, кто подал первым.
Как узнать, зарегистрирована ли ТМ в Голландии (или вообще по всему миру).
Найти кто сможет это сделать в патентном ведомстве той или иной страны.
Единой базы товарных знаков по всему миру - нет, в каждой стране своя система, своя охрана, своя база товарных знаков.