что-то вы лукавите: если то что они вам шьют, отчасти - правда, то вы по-просту распространяли без лицензии лицензионную копию клиентской части, игры. понятное дело на freebsd она не пойдет, но те, кто её мог скачать - явно под freebsd её запускать не станут, так ведь?
интересно, что именно нашли такого модифицированного в игре? изменяемые файлы, или статичные? всю инфу в изменяемых папках можно грохнуть, клиент её восстановит, из статичных архивов, из папки DATA. по сути - она самая важная, все - остальные папки не существенны..
после удаления этих папок - клиент восстановит настройки по-умолчанию, и будет коннектится на оффициальный сервер Близзард, т.е. - на ваш он уже не будет коннектится. каждый игрок это должен знать, т.е. - тут уже идёт моральный выбор игрока..
ну ещё *.exe файлы в корневой директории, конечно нужны.. но компания Близзард давненько уже встраивает проверку, если файлы битые (или изменены некорректно) - выдастяся ошибка и клиент запускаться/работать не будет.
проверить программу на работоспособность - можно сравнением по содержимому двух папок, оригинальной игры (ту что распространяет данная компания Б) и вашей. что самое забавное - проверка может не пройти (хотя бы, по тому что версии игры могут не совпадать, у вас 1.х.х а у них - 2.х.х), и если вы убедите судью, что раз у вас и у компании Б - файлы разные, значит - игра не будет работать так как надо, или вообще не запустится, значит - вам повезло
реально подтвердить работоспособность, можно - если снова запустить ваш сервер - и посмотреть что будет делать клиентская версия программы, чего, я так понимаю - они делать не будут.. как же они могут решать работоспособная ли игра? и куда коннектится данный клиент? а вдруг он не к вам коннектится, а не оффициальный сервер?
а файлы разными могут быть сделаны намеренно или нет, тут уже тогда - другой разговор..
и что мы имеем в итоге: хранение и распространение, клиентской версии игры не с целью обогащеия..
ну - от хранения, вам уже не отвертеться.. а вот насчёт распространения, тут ещё можно чтото помозговать..