Надо доказывать легальность ПО (как инструмента), на котором был разработан Продукт?
А кто нибудь знает, спрашивают ли у стоматолога легальность бормашины, когда приходят к нему на лечение? Вот если буду траблы, тогда, конечно, может всплыть и этот вопрос.
Первое, что нужно сделать, везде повставлять свой Copyright так, чтобы его невозможно было модифицировать или как-то скрыть. Хорошо отдокументировать исходники программы в бумажном виде и никому не давать доступ к ним. И неплохо было бы пакет документов как-то зарегать у нотариуса. Не все, а самую суть. Всякие там рюшечки - это легко отметается в качестве доказательств. А вот суть - это уже изменить невозможно. И желательно сделать две регистрации - на начальном этапе, когда суть уже описана в программе, и уже готового продукта.