Ну взяли они образец для сравнения, который у них в экспертом центре завалялся, а если на момент экспертизы правообладатель сменился, как эта экспертиза будет выглядеть с правовой точки зрения. Сравнивали программы одного правообладателя, а оказалось, что правообладатель давно сменился и сменил название программы?
«Не следует привлекать новые сущности без самой крайней на то необходимости»
Уильям Оккам
А если дело было закрыто до суда, на предварительном следствии, например за недостаточностью улик или за отсутствием состава или события приступления. Имеет ли вы этом случае гражданин право на возмещения ущерба со стороны государтства
Почему бы нет? Если гражданин сможет доказать суду, что ему причинен ущерб. Имеет право требовать возмещения.
и понесут ли правоохранительные органы в этом случае должные дисциплинарные взыскания?
Побойтесь Бога. Вашими усилиями прекращений УД на стадии предварительного расследования вообще не будет а суды у нас сами знаете оправдательные приговоры, практически, не выносят.