Можете ли Вы как-то доказать принадлежность Вам прав на эту базу данных, кроме слов? Если нет - думаю, дело будет одинаково интересно любому хорошему юристу как с одной, так и с другой стороны.
А как еще можно доказать принадлежность мне или моей компании этой базы, которая существует только в интернете? На бумагах, разве что кроме какого-нибудь приказа о создании сайта ничего нет...
Есть свидетели, сотрудники компании, которые принимали участие в создании портала и наполнении/редактировании контента и программной части, структуры.
Можно попробовать доказать наличием страниц находящихся в кэше у Яндекса, Гугла, Веб-архива, то что это наша база данных.
Насколько я был в курсе, базы данных регистрировать необязательно, поэтому достаточно знака копирайта или предупреждения о том, что права защищены.